事业单位的编制就一类：事业编制。编制分为行政编制、事业编制、工勤编制，只有在党政机关才使用行政编制和工勤编制，干部使用行政编制，工人使用工勤编制，在事业单位，无论干部或者是工人，一律使用事业编制。现在，党政机关工勤人员只出不进，现有的工勤编制随工勤人员的调出、退休、死亡等“自然减员”，逐步消失并退出历史舞台。
事业单位的编制类型，虽然只有“事业编制”一类，但习惯上，在人们的实际使用中，还是将事业编制划分为不同的类型。事业单位按财政供养形式，分为全额、差额和自收自支事业单位，这是事业单位“三定方案”明确规定的。因而从机构编制管理部门来看，事业编制分为全额事业编制和差额事业编制，并且两者不可混用。全额事业编制是指分配给完全或者主要承担公益类职能的事业单位，比如社保、就业、农机、退役军人服务等各类中心。而差额事业单位主要是供一些既有公益职能又具备生产经营职能的事业单位，比如乡镇卫生院、公立医院等。生产经营类事业单位使用的自收自支事业编制，属于地方自定且自行供养的编制类型，已经明确要求全面取消，因而不再细述。
事业单位按职能性质，分为行政类、公益一类、公益二类、生产经营类。对应的，行政类和公益一类使用的编制为全额事业编制，公益二类事业单位部分使用全额、部分使用差额事业编制，唯有乡镇卫生院被划分为公益一类事业单位，使用差额事业编制。生产经营类事业单位使用自收自支编制。在事业单位分类改革中，行政类事业单位被撤销，承担的行政职能整合到相应的政府部门，公益类职能保留或者整合到其他保留的事业单位；公益二类事业单位将其承担的公益类职能保留或者整合，生产经营类职能推向社会；生产经营类事业单位全面改企。因而事业单位将来存在的主要职能性质是公益一类，主要存在的编制类型也是全额类。
还有一类分类方法，是按事业单位是否参公管理，将事业编制分为参公事业编制，纯事业编制。这是人为分类，不是正规的分类方式。参公事业编制依然是事业编制，如果将参公事业编制划分到纯事业单位，自然就变成纯事业编制了，连程序都不用走。