虽然两者都是在体制内的，但是有很多还是不一样，个人分析如下：
一是能力，在乡镇政府和局属事业单位工作，两者看似都在体制内考镇事业单位有什么前途，但是工作能力要求有一定不一样，乡镇政府工作性质比较复杂，考验一个人的综合协调能力，局属事业单位应该以业务工作为主，相对单纯；
二是发展，虽然乡镇工作基层经验是一个重要的事情。但是，到了局属事业单位，台阶是不一样的，在局属，你所接触的是部门领导，是为领导服务，你的思想高度应该是不一样的。如果表现好，你会被更高级的领导所注意，对于职务晋升和岗位轮换是有好处的；
三是环境，乡镇虽然较为灵活，上下班纪律也没有那么死板，圈子小，也不会把你管的太死，但是，基层事无巨细，直接接触矛盾而且面对各种考核，其实也是很累的，在考镇事业单位有什么前途县级机关，工作纪律要求严格，领导不走你也下不了班，加班是日常，而且写材料这个，领导说改就改，就算你在睡觉，他突然想起个什么你也得起来改，这也很累，两者累是相同的，不同的是只是县级机关相对单纯。
四是编制，总的说来，事业单位和行政岗位晋升途径不一样，目前来说，行政编制的晋升单纯，但有一定难度，好在职级和职务并轨，事业单位的话，多参加职考镇事业单位有什么前途称考试吧！