区别如下：
考试科目不同：专业阶段考试科目有6科，考试科目为会计、审计、财务成本管理、公司战略与风险管理、经济法、税法；综合阶段考试是对专业阶段考试内容进行综合考查，考试科目为职业能力综合测试（试卷一、试卷二）。专业阶段各科成绩有综合应用能力a类实务作答效期为5年，综合阶段没有年限要求。
考试题型不同：专业阶段考试主要是考察考生们对基础专业知识的掌握程度，考试有客观题和主观题；综合阶段考试主要是考察考综合应用能力a类实务作答生对所学的内容如何灵活运用，来解决实务问题。所以综合阶综合应用能力a类实务作答段考察题型为案例分析题。